Salmonella Heidelberg and Salmonella Minnesota in Brazilian broilers: Genomic characterization of third-generation cephalosporin and fluoroquinolone-resistant strains

Salmonella serovars Heidelberg and Minnesota encoding antimicrobial resistance to third-generation cephalosporins and fluoroquinolones are often detected in poultry/poultry meat. We analysed the genomes of 10 Salmonella Heidelberg (SH) and 4 Salmonella Minnesota (SM) from faecal isolates of Brazilian poultry. These featured virulent and multidrug-resistant characteristics, with AmpC beta-lactamase (blaCMY-2 ) predominance (9/14), for all SM (4/4) and some SH (3/10) located on IncC plasmid replicons. IncC carrying blaCTX-M-2 was only detected among SH (3/10). Mutation in the gyrA/parC genes was present in all SH, whereas SM harboured parC mutation plus qnrB19 on ColRNAI plasmids (3/4). In silico resistance overall corroborated with phenotypic results. Core genome phylogenies showed close clustering and high similarities between the Brazilian and poultry meat/food isolates from Europe, and to human isolates from European countries with documented import of Brazilian poultry meat. Conjugation assays with SM successfully transferred blaCMY-2 , and qnrB19 to an Escherichia coli recipient. The findings reinforce the ongoing antimicrobial resistance acquisition of SH and Minnesota and the risks for disseminating resistant strains and/or mobile elements which may increasingly affect importing countries and the need for controlling AMR in major poultry-exporting countries like Brazil.

Companion psittacine birds as reservoir of gentamicin and vancomycin-resistant Enterococcus spp / Psitacídeos de companhia como reservatórios de Enterococcus spp. gentamicina e vancomicina-resistentes

Enterococcus are recognized worldwide as significant nosocomial agents that have been continuously envolving to adapt to different niches and acquire resistance to several antibiotic classes. Vancomycin and gentamicin-resistant strains of E. faecalis and E. faecium have been associated with nosocomial human infections. Some epidemiological studies suggest the participation of pets as reservoirs of vancomycin and gentamicin-resistant Enterococcus strains. However, the role of companion birds as reservoirs of these strains has been poorly studied. In this study, 126 psittacine birds were evaluated and 26.9% carried Enterococcus spp., including the species E. faecalis, E. faecium, E. hirae, E. phoeniculicola, E. gallinarum and E. casseliflavus. The antibiotic resistance profile showed four high-level gentamicin-resistance (HLGR) strains. In addition, two strains presented intermediate levels of vancomycin resistance. Resistant strains were isolated from fecal and oropharynx samples of sick and clinically healthy birds, suggesting that psittacine birds may act as reservoirs of HLGR Enterococcus spp. However, sick birds appear to be more implicated in the enterococci transmission than healthy birds.(AU)

Enterococcus são reconhecidos mundialmente como significantes agentes nosocomiais, que têm continuamente se adaptado a diferentes nichos e adquirido resistência a várias classes de antibióticos. Cepas de E. faecalis e E. faecium vancomicina e gantamicina-resistentes têm sido associadas a infecções nosocomiais em humanos. Alguns estudos epidemiológicos sugerem a participação de aves como reservatórios de cepas de Enterococcus vancomicina e gentamicina-resistentes. Entretanto, a relação das aves de companhia como reservatórios destas cepas tem sido pouco estudada. Neste estudo, 126 psitacídeos foram avaliados, e 26,9% destes eram portadores de Enterococcus spp., incluindo as espécies E. faecalis, E. faecium, E. hirae, E. phoeniculicola, E. gallinarum e E. casseliflavus. O perfil de resistência antibiótica mostrou quatro cepas com alto nível de resistência a gentamicina (ANRG). Além de duas cepas com nível intermediário de resistência a vancomicina. As cepas resistentes foram isoladas de amostras fecais e de orofaringe de aves doentes e clinicamente saudáveis, sugerindo que psitacídeos podem estar atuando como reservatórios para Enterococcus spp. com ANRG. Contudo, Aves doentes parecem estar mais relacionadas à transmissão de enterococcus, do que aves saudáveis.(AU)

Enterococcus faecalis causes osteitis deformans in aGolden Lancehead snake (Bothrops insularis): a case report / Enterococcus faecalis causa osteíte deformante em uma serpente Jararaca-ilhoa (Bothrops insularis): relato de caso

Osteitis deformans (Paget's disease) is a chronic bone disorder characterized by excessive osteoclast-mediated bone resorption followed by new bone formation. The present paper reports this condition in an 18-year-old captive golden lancehead (Bothrops insularis) from Brazil. This patient initially exhibited anorexia and swelling in the middle third of the spine associated with locomotor disability. For diagnosis, radiography, ultrasound, computed tomography, cytology, and microbiological culture were performed. Diagnostic imaging showed bone changes, vertebral fusion, and bone proliferation. Cytology revealed blood cells how toxic heterophiles, reactive monocytes, young red blood cells, and polychromasia compatible with an infectious process. A bacterial culture identified an ampicillin-susceptible strain of Enterococcus faecalis. Antibiotic treatment was promptly started, but the snake died 25 days later. Histopathologically, the bone tissue showed a generalized thickening of the vertebral trabeculae. For the first time, the presence of E. faecalisassociated with the development of osteitis deformans in snakes was presented.(AU)

Osteíte deformante (Doença de Paget) é um distúrbio ósseo crônico caracterizado por reabsorção óssea excessiva mediada por osteoclastos, seguida por nova formação óssea. O presente trabalho relata essa condição em uma serpente jararaca-ilhoa (Bothrops insularis) do Brasil de 18 anos. O paciente apresentou inicialmente anorexia e um inchaço no primeiro terço médio da coluna associado com a incapacidade locomotora. O diagnóstico foi estabelecido com o apoio de radiografia, ultrassonografia, tomografia computadorizada, citologia e cultura microbiológica. O diagnóstico por imagem mostrou alterações ósseas, fusão de vértebras e proliferação óssea. A citologia mostrou células sanguíneas como heterófílos tóxicos, monócitos reativos, células sanguíneas jovens e policromasia compatíveis com um processo infeccioso. A cultura bacteriana identificou uma cepa de Enterococcus faecalis suscetível à ampicilina. O tratamento com antibióticos foi iniciado imediatamente, mas a serpente morreu 25 dias depois. Histopatologicamente, o tecido ósseo mostrou um espessamento generalizado das trabéculas vertebrais. Portanto, foi demonstrado pela primeira vez a presença de E. faecalis associada ao desenvolvimento de osteíte deformante em uma serpente.(AU)

Survey on pathogenic Escherichia coli and Salmonella spp. in captive cockatiels (Nymphicus hollandicus)

Abstract We surveyed healthy captive cockatiels (Nymphicus hollandicus) for Escherichia coli and Salmonella spp. Cloacal swabs were collected from 94 cockatiels kept in commercial breeders, private residencies and pet shops in the cities of São Paulo/SP and Niterói/RJ (Brazil). Three strains of E. coli from each individual were tested for the presence of ExPEC-, APEC- and DEC-related genes. We evaluated the blaTEM, blaSHV, blaOXA, blaCMY, blaCTX-M, tetA, tetB, aadA, aphA, strAB, sul1, sul2, sul3, qnrA, qnrD, qnrB, qnrS, oqxAB, aac (6)′-Ib-cr, qepA resistance genes and markers for plasmid incompatibility groups. Salmonella spp. was not detected. E. coli was isolated in 10% of the animals (9/94). Four APEC genes (ironN, ompT, iss and hlyF) were detected in two strains (2/27-7%), and iss (1/27-4%) in one isolate. The highest resistance rates were observed with amoxicillin (22/27-82%), ampicillin (21/27-79%), streptomycin (18/27-67%), tetracycline (11/27-41%). Multiresistance was verified in 59% (16/27) of the isolates. We detected strAB, bla TEM, tetA, tetB, aadA, aphaA, sul1, sul2, sul3 resistance genes and plasmid Inc groups in 20 (74%) of the strains. E. coli isolated from these cockatiels are of epidemiological importance, since these pets could transmit pathogenic and multiresistant microorganisms to humans and other animals.

Survey on pathogenic Escherichia coli and Salmonella spp. in captive cockatiels (Nymphicus hollandicus)

Abstract We surveyed healthy captive cockatiels (Nymphicus hollandicus) for Escherichia coli and Salmonella spp. Cloacal swabs were collected from 94 cockatiels kept in commercial breeders, private residencies and pet shops in the cities of São Paulo/SP and Niterói/RJ (Brazil). Three strains of E. coli from each individual were tested for the presence of ExPEC-, APEC- and DEC-related genes. We evaluated the blaTEM, blaSHV, blaOXA, blaCMY, blaCTX-M, tetA, tetB, aadA, aphA, strAB, sul1, sul2, sul3, qnrA, qnrD, qnrB, qnrS, oqxAB, aac (6)-Ib-cr, qepA resistance genes and markers for plasmid incompatibility groups. Salmonella spp. was not detected. E. coli was isolated in 10% of the animals (9/94). Four APEC genes (ironN, ompT, iss and hlyF) were detected in two strains (2/277%), and iss (1/274%) in one isolate. The highest resistance rates were observed with amoxicillin (22/2782%), ampicillin (21/2779%), streptomycin (18/2767%), tetracycline (11/2741%). Multiresistance was verified in 59% (16/27) of the isolates. We detected strAB, bla TEM, tetA, tetB, aadA, aphaA, sul1, sul2, sul3 resistance genes and plasmid Inc groups in 20 (74%) of the strains. E. coli isolated from these cockatiels are of epidemiological importance, since these pets could transmit pathogenic and multiresistant microorganisms to humans and other animals.

Captive wild birds as reservoirs of enteropathogenic E. coli (EPEC) and Shiga-toxin producing E. coli (STEC)

ABSTRACT Psittacine birds have been identified as reservoirs of diarrheagenic Escherichia coli, a subset of pathogens associated with mortality of children in tropical countries. The role of other orders of birds as source of infection is unclear. The aim of this study was to perform the molecular diagnosis of infection with diarrheagenic E. coli in 10 different orders of captive wild birds in the state of São Paulo, Brazil. Fecal samples were analyzed from 516 birds belonging to 10 orders: Accipitriformes, Anseriformes, Columbiformes, Falconiformes, Galliformes, Passeriformes, Pelecaniformes, Piciformes, Psittaciformes and Strigiformes. After isolation, 401 E. coli strains were subjected to multiplex PCR system with amplification of genes eae and bfp (EPEC), stx1 and stx2 for STEC. The results of these tests revealed 23/401 (5.74%) positive strains for eae gene, 16/401 positive strains for the bfp gene (3.99%) and 3/401 positive for stx2 gene (0.75%) distributed among the orders of Psittaciformes, Strigiformes and Columbiformes. None of strains were positive for stx1 gene. These data reveal the infection by STEC, typical and atypical EPEC in captive birds. The frequency of these pathotypes is low and restricted to few orders, but the data suggest the potential public health risk that these birds represent as reservoirs of diarrheagenic E. coli.

Prebiotic effects of inulin extracted from burdock (Arctium lappa) in broilers / Efeito prebiótico da inulina extraída da bardana (Arctium lappa) em frangos de corte

The aim of this study was to evaluate the prebiotic effect of burdock (Arctium lappa) in commercial poultry. Four experiments were conducted to evaluate the performance parameters and the protection after challenge with Salmonella Enteritidis and Salmonella Kedougou, with and without Bifidobacterium probiotic. In two trials, the chickens were fed with flour burdock 1% during 42 days. In the other two, the chickens were fed with fructan extracted from burdock (inulin), by gavage, at a concentration of 100 mg/bird, during the first three days of life. The results showed that the broilers treated with burdock flour showed underperformed, with less weight gain from the second week, and the worst results in the fattening stage. The treated birds had diarrhea and impaired intestinal integrity. However, the groups treated with the flour had a lower rate of intestinal colonization by Salmonella Kedougou, after challenge. No statistically significant differences were detected in the performance parameters of broilers receiving the inulin, and the morphometric analysis showed no lesions in the intestinal villi. However, there was no protection in the challenge with Salmonella Enteritidis, regardless of association with probiotic. These results demonstrated that the manner of administration has influence on the prebiotic effect of burdock. The burdock flour was administered for 42 days, which may have influenced intestinal mucosal injury. Instead, the inulin was given only in the first three days, which may have been insufficient for protection against Salmonella. New experiments are needed to determine an able formulation for a protective effect, without negative impact on growth, weight gain and feed conversion of the supplemented animals.(AU)

Este projeto teve por objetivo avaliar o efeito prebiótico da bardana (Arctium lappa) em aves comerciais. Foram realizados quatro experimentos para avaliar os parâmetros zootécnicos e o grau de proteção após o desafio com Salmonella Kedougou e Salmonella Enteritidis, com e sem a adição de probióticos à base de Bifidobacterium. Em dois experimentos, as aves receberam a farinha de bardana 1% na ração, durante 42 dias. Nos outros dois, as aves receberam o frutano extraído da bardana (inulina), por gavagem, na concentração de 100 mg/ave, nos três primeiros dias de vida. Os resultados demonstraram que os frangos tratados com farinha de bardana apresentaram desempenho zootécnico inferior ao controle, com menor ganho de peso a partir da segunda semana e piores resultados na fase de engorda. As aves tratadas apresentaram diarreia e comprometimento da integridade intestinal. Em contrapartida, os grupos tratados com a farinha tiveram menor taxa de colonização intestinal por Salmonella Kedougou, após o desafio. Não foram detectadas diferenças estatisticamente significativas nos parâmetros zootécnicos dos frangos que receberam a inulina, e a análise morfométrica não evidenciou lesões nas vilosidades intestinais. No entanto, não houve proteção no desafio por Salmonella Enteritidis, independentemente da associação com probiótico. Esses resultados demonstraram que o modo de administração tem influência sobre o efeito prebiótico da bardana. A farinha de bardana foi administrada por 42 dias, o que pode ter causado a lesão da mucosa intestinal. Em contrapartida, a inulina foi administrada apenas nos primeiros três primeiros dias, o que pode ter sido insuficiente para proteção contra Salmonella. Novos experimentos são necessários para determinar uma formulação capaz de promover efeito protetor, sem impacto negativo no crescimento, ganho de peso e conversão alimentar dos animais suplementados.(AU)

Gram-negative bacterium isolated from cardinals (Paroaria coronata and P. dominicana) seized from illegal wildlife trade / Bactérias gram-negativas em cardeais (Paroaria coronata e Paroaria dominicana) apreendidos do tráfico de animais silvestres

Illegal wildlife trade removes millions of birds from nature every year. Among the most trafficked species of birds are redcrested cardinals (Paroaria coronata) and red-cowled cardinals (Paroaria dominicana). The cloacal microbiota of free-living passerines consists mainly of gram-positive bacilli and cocci, and gram-negative bacilli predominate in captive birds. Under stress and low immunity, gram-negative species may cause opportunistic infections. This study identified bacteria from cloacal microbiota of 49 specimens of P. coronata and P. dominicana seized from illegal wildlife trade in São Paulo (SP). In this study, 13 species of gram-negative bacteria, including Salmonella spp. and Pseudomonas aeruginosa were isolated. An increased occurrence of Escherichia coli was identified in 42/49 (85.7 %) of fecal samples. Among the E. coli strains, 21/42 belonging to the phylogenetic groups B2 and D, were related to extraintestinal pathogenic strains causing disease in humans. Klebsiella pneumoniae were isolated in 28/49 (57.1 %) samples. These results reinforce the fact that stressful conditions of illegal trade can favor the colonization of cloacal microbiota of these birds by pathogens, which represents a risk for their reintroductioninto the wild, including the transmission of diseases to humans and other animals...

Anualmente o tráfico de animais silvestres retira milhões de aves da natureza. Os cardeais (Paroaria coronata) e cardeais-donordeste (Paroaria dominicana) estão incluídos entre as espécies de aves mais traficadas. A microbiota cloacal de passeriformes de vida livre é composta principalmente por bacilos e cocos gram-positivos, já os bacilos gram-negativos predominam em aves de cativeiro. Em situações de estresse e baixa de imunidade as bactérias gram-negativas podem causar infecções oportunistas. O presente trabalho identificou bactérias da microbiota da cloaca de 49 espécimes de P. coronata e P. dominicana apreendidas do tráfico de animais silvestres em São Paulo (SP). Foram isoladas treze espécies de bactérias gram-negativas, incluindo Salmonella spp. e Pseudomonas aeruginosa. A maior frequência de ocorrência foi de Escherichia coli, identificada em 42/49 (85,7%) das amostras fecais. Dentre os isolados de E. coli, 21/42 pertenciam aos grupos filogenéticos B2 e D, relacionados a estirpes patogênicas que causam doença extraintestinal em humanos. Klebsiella pneumoniae foi isolada em 28/49 (57,1%) das amostras. Esses resultados reforçam que as condições estressantes a que esses animais são submetidos em situações de tráfico, incluindo o contato com humanos, podem favorecer a colonização da microbiota cloacal das aves por patógenos, o que representa um risco para a sua reintrodução na natureza considerando-se o possível contato com humanos e outros animais...

A survey on gram-negative bacteria in saffron finches (Sicalis flaveola) from illegal wildlife tradein Brazil / Pesquisa de bactérias gram-negativas em canários-da-terra (Sicalis flaveola) resgatados do tráfico ilegal de aves no Brasil

Passerines such as canaries or finches are the most unlawfully captured species that are sent to wildlife centers in São Paulo, Brazil. Captured birds may have infection by opportunistic bacteria in stressful situations. This fact becomes relevant when seized passerine are reintroduced. The aim of this study was to evaluate the health state of finches from illegal wildlife trade using microbiological approaches. Microbiological samples were collected by cloacal and tracheal swabs of 100 birds, captured during 2012 and 2013. The results indicate high frequency of gram-negative bacteria in feces and oropharynx, especially from the Enterobacteriaceae family (97.5%). The most frequent genera were Escherichia coli (46.5%) and Klebsiella pneumoniae (10.4%). Enterobacter cloacae, Serratia liquefaciens, Serratia spp. Klebsiella oxytoca and Citrobacter freundii were isolated with lower frequency from asymptomatic birds. The presence of enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) and Shiga toxinproducing strain (STEC) confirm the zoonotic risks and public health concern.(AU)

No Estado de São Paulo, Brasil, os pássaros como os canários-da-terra têm sido uma das espécies mais frequentemente resgatadas do tráfico ilegal e enviadas aos centros de vida selvagem. Em situações de estresse estas aves podem ser acometidas por infecções causadas por bactérias oportunistas. Este fato é de grande importância quando é planejada da reintrodução das aves na natureza. O presente trabalho foi delineado para avaliar o estado de saúde de canários-da-terra resgatados do tráfico ilegal. Foram colhidas soabes da traqueia e da cloaca de 100 aves resgatadas durante os anos de 2012 e 2013. Os resultados obtidos revelaram alta frequência de bactérias gram-negativas nas fezes e no orofaringe dos animais, com maior frequência para os membros da família Enterobacteriaceae (97,5%). Os gêneros mais frequentes foram Escherichia coli (46,55) e Klebsiella pneumoniae (10,4%). Outros microorganismos incluindo Enterobacter cloacae, Serratia liquefaciens, Serratia spp, Klebsiella oxytoca e Citrobacter freundii também foram isolados em menor frequencia de aves assintomáticas. A presença de estirpes de Escherichia coli enteropagênicas (EPEC) e as produtoras da toxina de Shiga confirmam o risco de zoonose e a importância para saúde pública deste tipo de ave.(AU)

Salmonella Agona em Perus (Meleagris gallopavo) de criações comerciais no Brasil / Salmonella Agona in Turkeys (Meleagris gallopavo) in commercial farms from Brazil

Salmonella spp. é um dos principais agentes envolvidos em casos de doenças de origem alimentar em humanos, responsável por perdas significativas na avicultura. O presente trabalho investigou a presença de Salmonella spp. em fezes de perus comerciais no Brasil. Foram colhidos suabes fecais de 14 lotes de perus comerciais (pool de seis aves/lote). Os suabes foram submetidos aos procedimentos de isolamento bacteriológico convencionais e a detecção de DNA do agente foi realizada com a técnica de PCR. Salmonella spp. foi detectada em um total de nove lotes dos 14 avaliados. As amostras foram negativas na identificação molecular dos sorovares Enteritidis e Typhimurium. Os isolados foram encaminhados ao laboratório de referência para sorotipagem e identificados como S. Agona; um patógeno considerado emergente em vários países.

Abstract Salmonella spp. is one of the major players involved in cases of foodborne diseases in humans and is responsible for significant losses in the poultry industry. The aim of this study was to investigate the presence of Salmonella spp. in feces of commercial turkeys from Brazil. Fecal swabs from 14 turkey farms (pool of six poults/flocks) were collected. The swabs were subject to the conventional bacteriological isolation procedures and to DNA detection of the agent trough PCR. Salmonella spp. was present in a total of nine from 14 turkey farms evaluated. The samples were negative on molecular identification for serovars Enteritidis and Typhimurium. Isolated strains submitted to the reference laboratory for serotyping were identified as S. Agona that has been described as emergent pathogen in several countries.

Efficacy of bacterin-, outer membrane protein- and fimbriae extract-based vaccines for the control of Salmonella Enteritidis experimental infection in chickens / Eficácia de bactéria inativada (bacterina), proteína da membrana externa e extrato de fimbrias no controle de infecção experimental por Salmonella Enteritidis (SE) em galinhas

The efficacy of three vaccines was evaluated in chickens for the control of experimental infection with Salmonella Enteritidis (SE) phage type 4. The vaccines were produced with bacterin, outer membrane proteins (OMP) and fimbriae crude extract (FE). The chickens were vaccinated intramuscularly with two doses of each vaccine at 12 and 15 weeks of age. The chickens were then orally challenged with 10(9) CFU/chicken Salmonella Enteritidis phage type 4 at 18 weeks of age. Fecal swabs were performed for the recovery of shedding SE, and SE was recovered from the liver and spleen. Additionally, antibody titers were measured in the serum by micro-agglutination test. The results indicated that the vaccine produced with bacterin yielded better results and resulted in reduction of fecal shedding and organ invasion by SE after oral challenge, although no vaccine was 100% effective for the control of SE experimental infection.

A eficácia de três vacinas de Salmonella Enteritidis fagotipo 4, produzidas na forma de bacterina, proteínas de membrana externa (OMP) e extrato bruto de fímbrias (FE) foi avaliada para proteção de aves infectadas experimentalmente. As aves foram vacinadas por via intramuscular com duas doses de cada vacina as 12 e 15 semanas de idade e desafiadas com 10(9) UFCs de Salmonella Enteritidis fagotipo 4 às 18 semanas de idade, por via oral. A eficácia foi determinada através do reisolamento da bactéria nas fezes e no fígado e baço, e os anticorpos foram mensurados no soro. Os resultados demonstraram que a vacina produzida com a bacterina foi mais eficaz em comparação às outras vacinas examinadas, para reduzir a excreção fecal e a invasão de órgãos após o desafio por SE.

Antimicrobial resistance in veterinary medicine: mechanisms and bacterial agents with the greatest impact on human health / Resistência a antimicrobianos em medicina veterinária: mecanismos e agentes bacterianos de maior impacto em saúde humana

Many retrospective and prospective studies have been performed to understand the emergence and dissemination of antibiotic-resistant microorganisms. The rates of antimicrobial drug resistance among bacterial pathogens are high and now represent a worldwide concern, both in human medicine and veterinary practices. The aim of this review is to describe the mechanisms of antibiotic resistance and the risks associated with antimicrobial use in animal production. Pathogens with major impacts on human and animal health are discussed, including multidrug-resistant and extensi- vely drug-resistant Gram-negative and Gram-positive bacteria.

Vários estudos retrospectivos e prospectivos têm sido realizados para investigar o aumento e a disseminação de microorganismos resistentes a antimicrobianos. As taxas de resistência entre esses agentes são crescentes e representam uma preocupação mundial, tanto em medicina humana como em veterinária. O objetivo da presente revisão é descrever os mecanismos de resistência antimicrobiana e os riscos associados ao uso de antimicrobianos na produção animal. Os patógenos de maior impacto em saúde humana e animal são abordados, incluindo bactérias Gram-negativas e Grampositivas multirresistentes e extensivamente resistentes.

Genetic similarity between APEC and Escherichia coli strains isolated from Guaruba guarouba in a survey on healthy captive psittacine birds / Similaridade genética entre APEC e cepas de Escherichia coli isoladas de Guaruba guarouba em um estudo com psitacídeos hígidos de cativeiro

The role of psittacine birds as a reservoir of avian pathogenic Escherichia coli (APEC) is not known but would be helpful in understanding the human – animal interface, since the enteric microbiota of these birds consists of Gram positive bacteria. The aim of this study was to identify the presence of APEC in feces of clinically healthy Guaruba guarouba. To do this, we isolated and analyzed E. coli from cloacal fecal samples taken from 87 psittacine birds from six zoologic parks, three commercial breeders and one conservation breeder. Of the 87 birds examined, 46 (52.87%) presented E. coli in feces. The presence of the following eight virulence genes was determined by the polymerase chain reaction (PCR): irp2, iucD, iss, vat, cvi/cva, tsh, astA, and papC, and 29 (63.04%) of 46 E. coli isolates tested were positive at least one of the eight genes studied. The frequency of virulence genes observed in isolates of E. coli were 32.6% (15/46) irp2, 26% (12/46) iucD, 19.5% iss (9/46), 17.4% vat (8/46), 17.4% cvi/cva (8/46), 8.7% tsh (4/46), 4.4% astA (2/46) and 0% papC (0/46). The isolates were grouped in 13 genotypic profiles according to virulence gene combinations, but only 2 isolates were classified as APEC, with the pattern iuc, iss, cvi/cva, irp + and iuc, iss, cvi/cva, irp, tsh, vat +. This study reveals the presence of APEC in clinically healthy captive G. guarouba, suggesting that these psittacine birds may act as reservoir for pathogenic microorganisms. Epidemiological studies are needed to determine the relevance of this species as a reservoir and the implications for conservation of endangered species G. guarouba.

O papel dos psitacídeos como reservatório de Escherichia coli patogênicas para aves (APEC) não é conhecido, mas será útil para a compreensão da interface humano-animal, uma vez que a microbiota entérica destas aves é composta por bactérias Gram-positivas. O objetivo deste estudo foi identificar a presença de APEC em fezes de Guaruba guarouba clinicamente saudáveis. Para isso, foram isoladas e analisadas E. coli presentes em fezes cloacais coletadas de 87 psitacídeos, alojados em seis zoológicos, três criatórios comerciais e um criatório conservacionista. Das 87 aves examinadas, 46 (52,87%) apresentaram E. coli nas fezes. A presença de oito genes de virulência foi determinada pela reação em cadeia pela polimerase (PCR): irp2, iucD, iss, vat, cvi/cva, tsh, astA, e papC, e 29 (63,04%) dos 46 isolados foram positivos para pelo menos um dos oito genes estudados. A frequência dos genes de virulência observada nos isolados de E. coli foi 32.6% (15/46) irp2, 26% (12/46) iucD, 19.5% iss (9/46), 17.4% vat (8/46), 17.4% cvi/cva (8/46), 8.7% tsh (4/46), 4.4% astA (2/46) e 0% papC (0/46). Os isolados foram agrupados em 13 perfis genotípicos de acordo com combinações de genes de virulência, mas apenas duas amostras foram classificadas como APEC, com o perfil iuc, iss, cvi/cva, irp + e iuc, iss, cvi/cva, irp, tsh, iuc, iss, +. Este estudo revela a presença de APEC em aves de cativeiro (G. guarouba) clinicamente saudáveis, sugerindo que estes psitacídeos possam atuar como reservatórios de micro-organismos patogênicos. Estudos epidemiológicos são necessários para determinar a relevância desta espécie como reservatório e as implicações para a conservação da espécie ameaçada G. guarouba.

Sorogrupos e genes de virulência em Escherichia coli isoladas de psitacídeos / Serogroups and virulence genes of Escherichia coli isolated from psittacine birds

Escherichia coli isolates from 24 sick psittacine birds were serogrouped and investigated for the presence of genes encoding the following virulence factors: attaching and effacing (eae), enteropathogenic E. coli EAF plasmid (EAF), pili associated with pyelonephritis (pap), S fimbriae (sfa), afimbrial adhesin (afa), capsule K1 (neu), curli (crl, csgA), temperature-sensitive hemagglutinin (tsh), enteroaggregative heat-stable enterotoxin-1 (astA), heat-stable enterotoxin -1 heat labile (LT) and heat stable (STa and STb) enterotoxins, Shiga-like toxins (stx1 and stx2), cytotoxic necrotizing factor 1 (cnf1), haemolysin (hly), aerobactin production (iuc) and serum resistance (iss). The results showed that the isolates belonged to 12 serogroups: O7; O15; O21; O23; O54; O64; O76; O84; O88; O128; O152 and O166. The virulence genes found were: crl in all isolates, pap in 10 isolates, iss in seven isolates, csgA in five isolates, iuc and tsh in three isolates and eae in two isolates. The combination of virulence genes revealed 11 different genotypic patterns. All strains were negative for genes encoding for EAF, EAEC, K1, sfa, afa, hly, cnf, LT, STa, STb, stx1 and stx2. Our findings showed that some E. coli isolated from psittacine birds present the same virulence factors as avian pathogenic E. coli (APEC), uropathogenic E. coli (UPEC) and Enteropathogenic E. coli (EPEC) pathotypes.

Amostras de Escherichia coli isoladas de 24 psitacídeos doentes foram sorogrupadas e investigadas para a presença de genes que codificam os seguintes fatores de virulência: attaching e effacing (eae), plasmídeo EAF (EAF), pili associado à pielonefrite (pap), fímbria S (sfa), adesina afimbrial (afa), cápsula K1 (neu), curli (crl, csgA), hemaglutinina termosensível (tsh), enterotoxina termo-estável 1 de E. coli enteroagregativa (astA), toxina termolábil (LT) e toxina termoestável (STa e STb), Shiga-like toxinas (stx1 e stx2), fator citotóxico necrotizante 1 (cnf1), hemolisina (hly), produção de aerobactina (iuc) e resistência sérica (iss). Os resultados mostraram que os isolados pertenciam a 12 sorogrupos: O7; O15; O21; O23; O54; O64; O76; O84; O88; O128; O152 e O166. Os genes de virulência encontrados foram: crl em todos os isolados, pap em 10 isolados, iss em sete isolados, csgA em cinco isolados, iuc e tsh em três isolados e eae em dois isolados. A combinação dos genes de virulência revelou 11 perfis genotípicos distintos. Todas as amostras foram negativas para os genes que codificam EAF, EAEC, K1, sfa, afa, hly, cnf, LT, STa, STb, stx1 e stx2. Estes resultados demonstraram que algumas amostras de E. coli isoladas de psitacídeos apresentam os mesmos fatores de virulência presentes nos patotipos de E. coli patogênicas para aves (APEC), uropatogênicas (UPEC) e E. coli enteropatogênicas (EPEC).

Salmonella Yoruba infection in white-tufted-ear marmoset (Callithrix jacchus) / Infecção por Salmonella Yoruba em sagui-de-tufo-branco (Callithrix jacchus)

The aim of this study was to describe a fatal salmonellosis case in a non-human female primate (Callithrix jacchus), found in the illegal pet trade in Brazil. The marmoset was sent to the quarantine section of the Guarulhos City Zoo and died in the sequence of an episode of profuse diarrhea. Necropsy findings included mucous enteritis, and liver enlargement and necrosis. Feces and liver fragments were collected for bacteriological tests, which indicated the presence of Salmonella sp.; it was subsequently characterized as pertaining to the Yoruba serotype. The susceptibility profile demonstrated resistance to tetracycline only. The strain was positive for genes that encoded the virulence factors investigated (invA, sefC, pefA and spvC). The results indicated the risk of introduction of Salmonella pathogenic serotypes in primates in captivity.

O objetivo deste trabalho foi descrever um caso fatal de salmonelose em uma fêmea primata não humana (Callithrix jacchus), originária de tráfico ilegal no Brasil. O sagui foi enviado para seção de quarentena do Zoológico Municipal de Guarulhos e morreu após um episódio de diarréia profusa. Achados de necropsia incluíram enterite mucosa, hepatomegalia e necrose do fígado. Fezes e fragmentos do fígado foram coletados para testes bacteriológicos e indicaram a presença de Salmonella sp.; subsequentemente caracterizada como sorotipo Yoruba. O perfil de suscetibilidade mostrou resistência somente à tetraciclina. A cepa foi positiva para os genes que codificam os fatores de virulência investigados (invA, sefC, pefA and spvC). Os resultados indicaram o risco de introdução de sorotipos patogênicos de Salmonella por primatas em cativeiro.

Caracterização molecular dos fatores de virulência de estirpes de Escherichia coli isoladas de papagaios com colibacilose aviária / Molecular characterization of virulence factors in Escherichia coli strains isolated from parrots with colibacilosis

Oito amostras de Escherichia coli isoladas de papagaios com colibacilose aviária foram sorogrupadas e investigadas para a presença dos fatores de virulência: pili associado a pielonefrite (pap), fímbria S (sfa), adesina afimbrial (afa), cápsula K1 (neu), curli (crl, csgA), hemaglutinina termosensível(tsh), enterotoxinas termo-lábil (LT) e termo-estável (STa eSTb), Shiga-like toxinas (Stx1 e Stx2), Fator citotóxico necrotizante(cnf1), hemolisina (hly), aerobactina (iuc) e resistência sérica (iss). Os resultados mostraram que os isolados pertenciam a seis sorogrupos:O23; O54; O64; O76; O128 e O152. Os genes de virulência detectados foram: crl+ em todos os isolados; pap+; iss+ e iuc+ em três isolados, tsh+em dois isolados. Todas as amostras foram negativas para os genes neu, csgA, sfa, afa, hly, cnf e para as toxinas LT, STa, STb, Stx1 e Stx2.Estes resultados sugerem que amostras de E. coli isoladas de papagaios apresentam alguns fatores de virulência das amostras do patotipo de E. coli patogênica para aves (APEC).

A total of eight Escherichia. coli isolates from psittacine birds were serogrouping and investigated for the virulence factors: pili associated with pyelonephritis (pap), S fimbriae (sfa), afimbrial adhesin (afa), capsule K1 (neu), curli fibers (crl, csgA), temperature-sensitive hemagglutinin (tsh), heat labile (LT) and heat stable (STa and STb)enterotoxins, Shiga-like toxins (Stx1 and Stx2), Cytotoxic necrotizing factor (cnf1), haemolysin (hly), aerobactin production (iuc) and serum resistance (iss). The results showed that the isolates belonged to six serogroups: O23; O54; O64; O76; O128 and O152. The found virulence genes were: crl+ in all isolates, pap+, iuc+ and iss+ in three isolates; tsh+ in two isolates. All strains were negative for genes neu,csgA, sfa, afa, hly, cnf and LT, STa, STb, Stx1, Stx2 toxins. Our findings suggested that some E. coli isolated from psittacine birds present some virulence factors of avian pathogenic E. coli (APEC) pathotype.

Some adhesins of avian pathogenic Escherichia coli (APEC) isolated from septicemic poultry in Brazil

Three hundred and fifty strains of E. coli isolated from septicemic poultry from seven states of Brazil were examined for presence of nine adhesion-encoding genes, hemagglutination and adherence to chicken tracheal cells (in vitro). Analysis of the strains by colony hybridization tests demonstrated that 93.7 percent of the isolates were fim +, 17 percent pap+ and 5.7 percent were sfa+. The mannose sensitive fimbriae occur with similar frequency in APEC isolated from all Brazilians states, while significant differences among pap and sfa genes distributions were observed. The results showed that 0.85 percent and 0.28 percent of APEC were positive for genes that encoded enteroaggregative adhesins and EPEC adherence factor, respectively. None of APEC was positive for DA, afa, Bfp and Eae probes. The adherence to chicken tracheal cells showed 96 percent positive strains, while hemagglutination assays showed 26.5 percent of the isolates were mannose sensitive and 21.7 percent were mannose resistant.

Trezentas e cinqüenta amostras de E. coli isoladas de aves com septicemia em sete estados do Brasil foram examinadas para a presença de nove genes codificadores de adesinas, hemaglutinação e aderência em células da traquéia (in vitro). A análise das amostras pela hibridização de colônias demonstrou que 93,7 por cento dos isolados eram fim +, 17 por cento pap+ e 5,7 por cento eram sfa+. As fímbrias manose sensíveis apresentaram uma distribuição uniforme em todos os estados do Brasil. No entanto, diferenças significativas na distribuição dos genes pap e sfa foram observadas. Os resultados mostraram que 0,85 por cento e 0,28 por cento das APEC foram positivas para os genes que codificam as adesinas enteroagregativas e o fator de aderência de EPEC, respectivamente. Nenhuma amostra foi positiva para as sondas DA, afa, Bfp e Eae. A aderência em células de traquéia de aves revelou 96 por cento de amostras positivas, enquanto os testes de hemaglutinação mostraram 26,5 por cento dos isolados mannose sensíveis e 21,7 por cento manose resistentes.

Occurrence of adhesin-encoding operons in Escherichia coli isolated from breeders with salpingitis and chicks with omphalitis

Ocorrência dos operons fim, pap e sfa em amostras de Escherichia coli isoladas de reprodutoras com salpingite e pintinhos com onfalite foi avaliada. A análise de 100 amostras através dos testes de hibridização de colônia mostrou que 78 (78%) amostras eram fim+, uma (1%) era sfa+, sete (7%) eram fim+ associada a pap+, oito (8%) eram fim+ e uma (1%) era fim+pap+sfa + e cinco (5%) amostras não hibridizaram com nenhuma sonda. Estes resultados sugerem que o operon fim pode ter um importante papel na patogenia da infecção de Escherichia coli em reprodutoras com salpingite e pintinhos com onfalite.